hkr.sePublications
Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Jämförelse mellan två analyskit för typning av det humana leukocytantigenet HLA-B*57
Kristianstad University, School of Education and Environment.
2017 (Swedish)Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 credits / 15 HE creditsStudent thesis
Abstract [sv]

Humana leukocytantigen (HLA) är en typ av proteiner som uttrycks på alla cellers yta, de karakteriseras som antigenpresenterande och är en mekanism som ryggradsdjur utvecklat för att lokalisera infekterade eller defekta celler. HLA presenterar peptider från cellens insida för immunförsvaret, vilket i sin tur aktiverar andra delar av immunförsvaret eller inducerar apoptos om främmande peptider presenteras. HIV är ett virus som infekterar celler som uttrycker CD4 på ytan, så som makrofager och T-hjälparceller som ingår i immunförsvaret. Dessa sjunker i antal och immunförsvaret blir försvagat. Obehandlad HIV leder till AIDS, därför är bromsmediciner som Abacavir viktigt. Abacavir har visat goda resultat, dock drabbas 5-8% av hypersensitivitetsreaktioner. Forskare har visat att dessa reaktioner är starkt relaterade till HLA-B*57:01 allelen. Genom screening av denna allel kan behandling med Abacavir undvikas för denna grupp patienter.

Syftet med denna studie var att jämföra två olika kit, Olerup SSP® HLA-B*57:01 och Inno-train HLA-READY GENE B57, för typning av HLA-B*57 i 20 olika DNA prover. Dessa jämfördes med den befintliga metoden för HLA-typning som används på klinisk immunologi och transfusionsmedicin, Universitetssjukhuset, Lund. Jämförelsen grundade sig på skillnader mellan kiten, både vad gäller resultat, kostnader och analystider. 

Proverna analyserades med PCR innan de separerades på agarosgel med gelelektrofores. Resultaten tolkades enligt tillverkarnas anvisningar. Resultaten visade att båda metoderna kan typa HLA korrekt. Alla resultat med Olerup stämde. Däremot blev 8 av 20 prover fel vid första körningen med Inno-train men resultaten stämde efter omkörning. Avseende kostnader är Inno-train billigare per prov men Olerup skulle bli billigare långsiktigt. För att verkligen fastställa vilket kit som är mest lämpligt behövs fler analyser utföras. 

Abstract [en]

Human leokocyte antigen (HLA), a protein present on the surface of our cells, is characterized as antigen-presenting a mechanism vertebrates have developed to locate infected or defect cells. HLA presents peptides which are brought from the cell's inside to be presented for the immune system.

HIV is a virus that infects cells that express CD4 on the surface, such as macrophages and T-helper cells. When these are decreasing, the immune system gets weakened. Untreated HIV leads to AIDS, therefore are inhibiting pharmaceuticals like Abacavir important. Abacavir has shown good results, unfortunately 5-8% gets hypersensitivity-reactions. Scientists have shown that these reactions are strongly related to the HLA-B*57:01 allele. By screening for this allele, treatment with Abacavir could be avoided for this group of patients.

The purpose of this study was to compare two different kits, Olerup SSP® HLA-B*57:01 and Inno-train HLA-READY GENE B57, for screening of HLA-B*57 in 20 different DNA samples. These have previously been typed with the established method at the clinical immunology and transfusion medicine, Lund University Hospital. The comparison was based on differences between the kits, both in terms of results, costs and analytical times.

PCR was run before the samples were separated on gel with electrophoresis. The results were interpreted in accordance to the manufactures instructions. The results showed that both methods could type HLA correctly. All results from Olerup was correct. However, 8 out of 20 samples showed wrong results at the first run with Inno-train. These were correct after a second run. In terms of costs, Inno-train is cheaper per test, but Olerup would be cheaper in the long term. To really determine which kit is most suitable, more analyzes are required.

Place, publisher, year, edition, pages
2017. , 23 p.
Keyword [en]
HIV, HLA, Abacavir, Hypersensitivity, PCR
Keyword [sv]
HIV, HLA, Abacavir, Hypersensitivitet, PCR
National Category
Immunology
Identifiers
URN: urn:nbn:se:hkr:diva-16931OAI: oai:DiVA.org:hkr-16931DiVA: diva2:1112767
External cooperation
Lunds Universitetssjukhus, Klinisk immunologi och transfusionsmedicin
Educational program
Bachelor of Science in Biomedical Laboratory Science
Supervisors
Examiners
Available from: 2017-06-21 Created: 2017-06-20 Last updated: 2017-06-22Bibliographically approved

Open Access in DiVA

fulltext(936 kB)14 downloads
File information
File name FULLTEXT01.pdfFile size 936 kBChecksum SHA-512
a9bf742e8b9154a281b3975a4dbffa34341a2720ffae10609b26fad6d4b4cddf8a5d4571aed7650d7615c86769a9b29fb3c1941f30e84444294c3641bd4d1ad5
Type fulltextMimetype application/pdf

Search in DiVA

By author/editor
Håkansson, Cornelia
By organisation
School of Education and Environment
Immunology

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar
Total: 14 downloads
The number of downloads is the sum of all downloads of full texts. It may include eg previous versions that are now no longer available

Total: 169 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf