hkr.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Tidsserieanalys av aktiv norovirus-infektion med RT-qPCR
Högskolan Kristianstad, Fakulteten för naturvetenskap.
2019 (Svenska)Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)Alternativ titel
Time-series analysis of active norovirus-infection with RT-qPCR (Engelska)
Abstract [sv]

Norovirus som orsakar vinterkräksjukan är en av de vanligaste vintersjukdomarna i Sverige. Sjukdomstiden varar generellt i en till tre dagar med symptomen kräkning och/eller diarré. Till den totala sjukdomsbilden världen över gällande akut gastroenterit, bidrar norovirus med 18 %. Trots att sjukdomen är mycket vanlig är kunskapen om norovirusets förfarande till stor del okänd.Syftet med studien var att göra en tidsserieanalys, även så kallad One-Step Growth analys, av koncentrationen minus-RNA i celler som infekterats med olika koncentrationer av murint norovirus (MNV). För att detektera minus-RNA användes RT-qPCR med SYBR Green. Målet var att se om startkoncentrationerna av virus vid någon tidpunkt korrelerar med mängden minus-RNA i cellerna. Efter 4 och 8 timmar fanns ett exponentiellt samband mellan den initiala viruskoncentrationen och minus-RNA-uttrycket i cellerna. Koncentrationen minus-RNA i de infekterade cellerna ökade mellan de undersökta tiderna 4, 8 och 24 timmar. Vidare visade resultaten att det krävs 4 timmar för att minus-RNA skulle vara kvantifierbar vid en högre infektionskoncentration av viruspartiklar, medan det krävs 24 timmar för den lägre infektionskoncentrationen av viruspartiklar.

Abstract [en]

Norovirus causes winter vomiting disease and is one of the commonest cause of winter illness in Sweden. The disease period generally lasts one to three days with symptoms like vomiting and/or diarrhea. To the disease burden of acute gastroenteritis worldwide, norovirus contributes with 18 %. Even though the illness is very common, the knowledge about norovirus is poor and largely unknown.The purpose of the study was to do a time series analysis, a so-called One-Step Growth analysis, of the minus-RNA concentration in cells infected with different concentrations of murine norovirus (MNV). For the detection of minus-RNA RT-qPCR was used with SYBR Green. The goal was to correlate start concentration of virus at any time with the amount of minus-RNA in the cells. At 4 and 8 hours there was an exponential connection by the initial virus concentration and minus-RNA development in the cells. The concentration of minus-RNA in the infected cells increased between 4, 8 and 24 hours. Further, the results can be interpreted as requiring 4 hours for the higher concentrations to become quantifiable, while requiring 24 hours for the lower concentrations to become quantifiable.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2019. , s. 26
Nyckelord [en]
RT-qPCR, SYBR Green, Norovirus, MNV, One-Step Growth Analysis, Winter vomiting disease
Nyckelord [sv]
RT-qPCR, SYBR Green, Norovirus, MNV, One-Step Growth Analysis, Vinterkräksjukan
Nationell ämneskategori
Biomedicinsk laboratorievetenskap/teknologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:hkr:diva-20077OAI: oai:DiVA.org:hkr-20077DiVA, id: diva2:1367302
Ämne / kurs
Biomedicinsk laboratorievetenskap
Utbildningsprogram
Biomedicinska analytikerprogrammet
Handledare
Examinatorer
Tillgänglig från: 2019-11-05 Skapad: 2019-11-02 Senast uppdaterad: 2019-11-05Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(805 kB)8 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 805 kBChecksumma SHA-512
9c7ab0336a55edae60396be717a896874924287846da307595135324df8f7e378e3c8e57a4a258ca88dd9574ce89930b84b51318d04a2d2ebf719c9129c1ce47
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Dahlin, Henrik
Av organisationen
Fakulteten för naturvetenskap
Biomedicinsk laboratorievetenskap/teknologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 8 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 11 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf