hkr.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Rapid detection of antibiotic resistance in positive blood cultures by MALDI-TOF MS and an automated and optimized MBT-ASTRA protocol for Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae
Högskolan Kristianstad, Fakulteten för naturvetenskap, Forskningsmiljön Man & Biosphere Health (MABH). Högskolan Kristianstad, Fakulteten för naturvetenskap, Avdelningen för miljö- och biovetenskap. Lunds universitet.ORCID-id: 0000-0003-0724-2718
Högskolan Kristianstad, Fakulteten för naturvetenskap, Forskningsmiljön Man & Biosphere Health (MABH). Högskolan Kristianstad, Fakulteten för naturvetenskap, Avdelningen för miljö- och biovetenskap. Lunds universitet.ORCID-id: 0000-0002-8059-0156
Lunds universitet.
2019 (Engelska)Ingår i: Infectious Diseases, ISSN 2374-4235, E-ISSN 2374-4243Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Introduction: For fast and effective antibiotic therapy of serious infections like sepsis, it is crucial with rapid information about antibiotic susceptibility, especially in a time when the number of infections caused by multi resistant bacteria has escalated in the world.Methods: Here, we have used a semi-quantitative MALDI-TOF-MS based method for antibiotic resistance detection, MBT-ASTRA™, which is based on the comparison of growth rate of the bacteria cultivated with and without antibiotics. We demonstrate a new protocol where several parameters have been optimized and automated leading to reduced hands-on time and improved capacity to simultaneously analyse multiple clinical samples and antibiotics.Results: Ninety minutes of incubation at 37 °C with agitation was sufficient to differentiate the susceptible and resistant strains of E. coli and K. pneumoniae, for the antibiotics cefotaxime, meropenem and ciprofloxacin. In total, 841 positive blood culture analyses of 14 reference strains were performed. The overall sensitivity was 99%, specificity 99% and the accuracy 97%. The assay gave no errors for cefotaxime (n = 263) or meropenem (n = 289) for sensitive and resistant strains, whilst ciprofloxacin (n = 289) gave six (0.7%) major errors (false resistance) and four (0.5%) very major errors (false susceptibility). The intermediate strains showed a larger variety compared to the E-test MIC values.Conclusions: The hands-on time and the analysis time to detect antibiotic resistance of clinical blood samples can be substantially reduced and the sample capacity can be increased by using automation and this improved protocol.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2019.
Nyckelord [en]
Enterobacteriaceae, MALDI-TOF-MS, MBT-ASTRA, antibiotic resistance, antibiotic susceptibility, blood culture, sepsis
Nationell ämneskategori
Mikrobiologi inom det medicinska området
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:hkr:diva-20071DOI: 10.1080/23744235.2019.1682658ISI: 000493138600001PubMedID: 31661349OAI: oai:DiVA.org:hkr-20071DiVA, id: diva2:1366750
Tillgänglig från: 2019-10-30 Skapad: 2019-10-30 Senast uppdaterad: 2019-11-27Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1579 kB)13 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1579 kBChecksumma SHA-512
6d7420667f9cc427c828917732ddc33c5bcb0e130834af8cf05b70dfd48f1b1783a61cf25aa5d1fa364519283efd9d65a468dfb3cf64c8948ed5b06f7823cc37
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Axelsson, Carolina

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Axelsson, CarolinaRehnstam-Holm, Ann-Sofi
Av organisationen
Forskningsmiljön Man & Biosphere Health (MABH)Avdelningen för miljö- och biovetenskap
I samma tidskrift
Infectious Diseases
Mikrobiologi inom det medicinska området

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 13 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 63 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf